Sequence alignment
Lysine
Display Taxonomy
Select an amino acid:  
Select:  and / or
- To display the typical 2D structure of all sequences,  submit  query.
- To display the typical 2D structure of individually selected organisms, check the box(es) checkbox and  submit  query.









Select size of: D-Loop  V-Region  T-Loop 
  Organism Acc-stem   D-stem D-loop D-stem   Ac-stem Anticd-loop Ac-stem V-region T-stem T-loop T-stem Acc-stem  
  1 8 10   22 26 27 32 39 44 49   61 66 73
Ornithorhynchus anatinus CATAAAG AA GCTA TTG     CAGC A GTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAT ACACT       TTCTC CTTTATG A
Tachyglossus aculeatus CATAAAG AA  GCTA TAG    TAGC A GTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC GAGAT ATCCT      TTCTC CTTTATG A
Zaglossus bruijni CATAAAG AA GCTA TAG     TAGC A GTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC GAGAT ATACT      TTCTC CTTTATG A
Elephas maximus CATTAAG AA GCTA TAA     TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGTAT GAGAA CATAGAA    TTCTC CTTAATG A
Loxodonta africana CATTAAG AA GCTA TAA     TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGTAT GAGAA CACAGAA     TTCTC CTTAATG A
Procavia capensis CGTTAAG AA GCTA ATAT    AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATA GGGAG CCTACAC    TTCCC CTTAACG A
Dugong dugon CATTGAG TA  GCTA AAC    TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGTAT GAGAG CCGAAC     TTCTC CTCAATG A
Elephantulus sp. VB001 CATTAAG AA GCTA ACT     GAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAT  GAGGA TTCAAATC   TCCTC CTTAATG A
Macroscelides proboscideus CATTAAG AA GCTA ATG TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAT GTGGA TAAGTC TCCTC CTTAATG A
Echinops telfairi CATTAAG AA GCTA TTT     AAGC A TTAAC CTTTTAA GTCAA AGACA GGGAA CCCTA       GTCCC CTTAATG G
Chrysochloris asiatica CACTGAG AA GCTA AATACT  AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TTTAAT     CTCTC CTCAATG A
Orycteropus afer CACTAAA AA GCTA ATATAA  AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG TATTAAT     CTCTC TTTAGTG A
Dasypus novemcinctus CCTTGAG AT GCTA TAA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TGCAACAAAT  CTCTC CTCAATG A
Choloepus didactylus ATTAGAG AA GCTG TTC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGGAA CCTAAAA    CTCCC CTCAATG A
Cavia porcellus CATTACG AA GCTA ATTG    CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC GGGGC CCAAA       TCCCC CGTAATG A
Jaculus jaculus CATTATG AA GCTT ATA     GAGC A TTAGC CTTTTAA GCTAA AGAA  GGAGC ATAAA      GCCCC CATAATG G
Mus musculus CACTATG AA GCTA A       GAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGTTA GAGAC CTTAAA      ATCTC CATAGTG A
Mus musculus domesticus CACTATG AA GCTA A       GAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGTTA GAGAC CTTAAA     ATCTC CATAGTG A
Mus musculus molossinus CACTATG AA GCTA A GAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGTTA GAGAC CTTAAA ATCTC CATAGTG A
Myoxus glis CATTATG AA GCTA AAC     AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAA TAATTAA     TTTCT CATAATG A
Nannospalax ehrenbergi CATTATG AA GCTT T       TAGC G CTAGC CTTTTAA GCTAG AAATA GGGAA TCTAA      ATCCC CATAATG A
Rattus norvegicus CATTGCG AA GCTT A       GAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGTTA GAGAC AACAA       ATCTC CACAATG A
Sciurus vulgaris CATTATG AA GCTA ACA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AGGAG TTTAAAC     CTCCT CATAATG A
Thryonomys swinderianus CATTATG AA GCTA TTTGC   AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG ATGAAATT    CTCTC CATAATG A
Lepus europaeus CATTATG AA  GCTA AG     TAGC G CTAGC CTTTTAA GCTAG AGAAT GAGAG CTAAGTAACA CTCTC CATAATG G
Ochontona collaris CATTATG AA GCTA GT      AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG CCCTAAT     CTCTC CATAATG A
Ochotona princeps CATTATG AA GCTA AC      AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG CCCTAAT    CTCTC CATAATG A
Oryctolagus cuniculus CGCTATG AA GCTA AA      CAGC G CTAGC CTTTTAA GCTAG AGAGT GAGAG TTAAATAGT   CTCTC CATAGTG A
Cebus albifrons CACTGTA AA GCTA CT      TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACA GAGAG AAT         CTCTC TACAGTG A
Colobus guereza CGCTGTA CA GCTA TTA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATC GAGAA ACCCTTC    TTCTC TACAGCG A
Gorilla gorilla CACTGTA AA GCTA ACC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG TATCGGCAC   CTCTT TGCAGTG A
Homo sapiens CACTGTA AA GCTA ACT TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG AACCAACAC CTCTT TACAGTG A
Hylobates lar CACTGTA GA GCTA AAT     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG GACCACTAC   CTCTT TACAGTG A
Lemur catta CACTACG AA  GCTA AT     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAAAG CTCAAAC    CTTTC CGCAGTG A
Macaca mulatta CACTGTA TA GCTA TCT     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAC  GGGGG ACACA      CCCCC TACAGTG A
Macaca sylvanus CACTGTA CA GCTA TCC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAC  GGGGG CAAAGACACA CCCTC TGCAGTG G
Nycticebus coucang CACTGTG AA GCTA AT      AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAAAG TTATAAGAA   CTGTC CACAGTG A
Pan paniscus CACTGTA AA GCTA ACC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCAACAC   CTCTT TACAGTG A
Pan troglodytes CACTGTA AA GCTA ACC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT AAGAG GACCGACAC   CTCTT TACAGTG A
Papio hamadryas CACTGTA CA GCTA TTC     CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGG CATG        CTCTC TGCAGTG A
Pongo pygmaeus CATTGCA AA GCTA ACC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AACCAGCCT   CTCTT TGCAATG A
Pongo pygmaeus abelii CACTGCA AA GCTA ATC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT AAGAG AATCAACCC   CTCTT TGCAGTG A
Tarsius bancanus CACTGCG AA GCTT ATA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC GAAAG TACTAAT     CTTTC CACAGTG A
Trachypithecus obscurus CACTGTA TA GCTA CTA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAC  GAGGA TACACT     TTCTC TGCAGTG A
Tupaia belangeri CACTATG AA GCTA G       TAGC G CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATA AGGGA CTCCACA     ACCCC CATAGTG A
Cynocephalus variegatus CATCGTG AA  GCTG AA     CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GGAAG TACTAAC    CTTCC CACAATG A
Crocidura russula CATTAAG AA GCTA TAG     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GAGAG CTTAGAC    CTCCC CTTAATG G
Echinosorex gymnura CATTAAG AA  GCTA GAA    CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA TAATC GAGAG TATCTAAT   CTCTC CTTAATG A
Episoriculus fumidus CATCAAG AA GCTA AATAT   CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGGAT TTCAAG      ATCCC CTTGATG G
Erinaceus europaeus CACTAAG AA GCTA G       TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAA GGAAG TTCCAA      TTTCC CTTAGTG C
Hemiechinus auritus CACTAAG AA GCTA G       TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATA GGAGA CCTTAA     ATTCC CTTAGTG T
Mogera wogura CATTAAG AA GCTA ACTTC   AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CTCAAAC    CTCTC CTTAATG A
Sorex unguiculatus CATTAAG AA GCTA TTG     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATC GAGAG CATCAACC   CTCTC CTTAATG A
Talpa europaea CATTAAG AA GCTA TTT     AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GAGAG CTCAGAC     CTCTC CTTAATG A
Urotrichus talpoides CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GAGAG CCCAGAC    CTCTC CTTAATG A
Artibeus jamaicensis CATTAAG AA GCTA TCT     TAGC G CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GGGAA TATAAGC     TTCCC CTTAATG A
Chalinolobus tuberculatus CATTAAG AA GCTA AT      TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAAAG CACTAAT     CTTTC CTTAATG A
Mystacina tuberculata CATTAGG AA GCTA ATTTA   CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGAAG TTAAGAAT   CTTCC CTTAATG G
Pipistrellus abramus CATTAAG AA GCTA A       TAGC A CCAGC CTTTTAA GTTGG AGATT GAGAG TTTAAAT    CTTTC CTTAATG A
Pteropus dasymallus CATTAAG AA GCTT ATTTTA  AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGAAG TACTAAC     CTCCC CTTAATG G
Pteropus scapulatus CATTAAG AA GCTT ATTTTA  AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGAAG TACAAAC     CTCCC CTTAATG A
Rhinolophus monoceros CATTAAG AA GCTA AGC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGA CCAGCCC    CCCTC CTTAATG A
Rhinolophus pumilus CATTAAG AA GCTA AGC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGA CCAGCCC    CCCTC CTTAATG A
Balaena mysticetus CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CCCAAA     CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera acutorostrata CGTTAAG AA GCTA AAT     TAGC G TCAAC CTTTTAA GTTGA AGACT GAGAG CTTATAA    CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera bonaerensis CATTAAG AA GCTA AATT    TAGC G TCAAC CTTTTAA GTTGA AGATT GAGAG CCTATGA    CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera borealis CATTAAG AA GCTA AAC     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CTTATAA    CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera brydei CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CTTATAA    CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera musculus CATTAAG AA GCTA AAT     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CCTATAA     CTCCC CTTAATG A
Balaenoptera physalus CATTAAG AA GCTA AAT     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG TCTATAA     CTCTC CTTAATG A
Berardius bairdii CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAAAG TCCAAA     CTTTC CTTAATG G
Bos grunniens CACTAAA AA GCTA TA      TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CAGTATG    CTCTC CTTGGTG A
Bos indicus CACTAAG AA GCTA TA      TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CCATATA    CTCTC CTTGGTG A
Bos taurus CACTAAG AA GCTA TA      TAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATT GAGAG CCATATA     CTCTC CTTGGTG A
Bubalus bubalis CACCAAG AA GCTG TAC     CAGC A CTAGC CTTTTAA GTTAG AGATA GGGAG CATTATA    CTCTC CTTGGTG A
Capra hircus CATCAAG AA GCTA TG      TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACC GAGAG CATAATA    CTCTC CTTGATG A
Eschrichtius robustus CATTAAG AA GCTA AA      TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG CCTACGG    CTCTC CTTAATG A
Eubalaena australis CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CCCAAAC    TCCCC TGTAATG G
Eubalaena japonica CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CCCAAA     CTCCC CTTAATG A
Herpestes javanicus CATTAAG AA GCTA AAC     AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGGAA TTTAAC     CTCCC CTTAGTG A
Hippopotamus amphibius CATTAAG AA GCTA G       TAGC G CTAAC CTTTTAA GTTAG AGACT GAGAG CCAAG       CTCTC CTTAATG A
Hyperoodon ampullatus CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAAAG CCCAAA     CTTTC CTTAATG G
Inia geoffrensis CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGGAG TTATAAA    CCCCC CTTAATG G
Kogia breviceps CATTAAG AA GCTA ATC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG CCAAAG     CTCCC CTTAATG A
Lagenorhynchus albirostris CACTAAG AA GCTA AAT     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAG TTATAAG    CTCCC CTTAGTG A
Lama pacos CACTAAG AA GCTA GT      CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GAGAA CTATAAA     CTCTC CTTAGTG A
Megaptera novaeangliae CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGAA CCTATAA    TTCTC CTTAATG A
Monodon monoceros CATTAAG AA GCTA AAC     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG CTATACA    CTCTC CTTAATG A
Muntiacus crinifrons CATTAAG AA GCTA AGA     TAGC A CTAGC CTTTTAA GCTAG AGACT GAGGG CACAATA    CCCTC CTTAATG A
Muntiacus muntjak CATTAAG AA GCTA AAA     TAGC A CTAGC CTTTTAA GCTAG AGACT GAGGG CACAATTA   CCCTC CTTGATG A
Muntiacus reevesi CATTAAG AA  GCTA AAA    TAGC A CTAGC CTTTTAA GCTAG AGACT GAGGG CACAATA    CCTTC CTTAATG A
Ovis aries CATCAAG AA GCTA TCC     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAA TATTATA     TTCTC CTTGATG A
Phocoena phocoena CATTAAG AA GCTA GGC     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGGAG CTACACA    TTCCC CTTAATG A
Physeter catodon CATCAAG AA GCTA AAC TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGAAT GAGAG CCCAAGC CTCCC CTTGATG A
Platanista minor CATTAAG AA GCTA AAA     TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG ACAAGA     CTCCC CTTAATG A
Pontoporia blainvillei CATTAAG AA GCTA AACT    CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GGAAA ACATGAA    TTTCC CTTAATG A
Sus scrofa CATTGAG AA GCTA GT      CAGC A CTAAC CTTTTAA GTTAG AGATC GGGAG CCTAAAT     CTCCC CTCAATG G
Ceratotherium simum CATTAAG AA GCTA TA      TAGC G TTAGC CTTTTAA GTTGA AGATT GAGAG CCCAAAT     CTCTC CTTAATG A
Equus asinus CACTAAG AA GCTA ATA     CAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG TTCAATCT    CCCTC CCTAGTG A
Equus caballus CACTAAG AA GCTA TTA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAGGG TTCAACC     CCCTC CCTAGTG A
Rhinoceros unicornis CATTAAG AA GCTA CA      CAGC G TCAAC CTTTTAA GTTGA AGACC GAGAG CCCAAAT     CTCTC CTTAATG A
Tapirus terrestris CATTAAG AA GCTA TA      TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGGG TCTAAGT    CCCTC CTTAATG A
Manis tetradactyla CATTAAG AA  GCTA G      TAGC G CTAAC CTTTTAA GTTAG AAATA GAGAA TAAATCT    TTCTC CTTAATG A
Acinonyx jubatus CATTGAG AA GCTA AAC     AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGGAG TTTAGAC    CTCCC CTTAATG G
Arctocephalus forsteri CACTAAG AA  GCTA TA     TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT GAGAG TGCCCCAAC  CTCTC CTTAGTG A
Canis familiaris CATTAAG AA GCTA TA      AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGGAG TTTTAAC     CTCTC CTTAATG A
Eumetopias jubatus CACTAAG AA  GCTA TA     CAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AAATT GTGAG TATCCTAAC  CTCCC CTTAGTG A
Felis catus CATTAAG AA GCTA AAT     AAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GGGAG TTTAAAT     CTCCC CTTAATG A
Halichoerus grypus CATTAAG AA GCTA TA      TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TACTCTAAC   CTCTC CTTAATG A
Odobenus rosmarus rosmarus CATTAAG AA  GCTA TA     AAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGATT GAAGG TATTCTAGC  CCTTC CTTAATG A
Phoca vitulina CATTAAG AA GCTA TA      TAGC A TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAG TCCTCTAAT   CTCTC CTTAATG A
Ursus americanus CATTAAG AA  GCTA ATA    TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAA TGCAAAC    TTCTC CTTAATG A
Ursus arctos CATTGAG AA  GCTA ACA    TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAA TGCAAAC    TTCTC CTTAATG A
Ursus maritimus CATTGAG AA  GCTA ACA    TAGC G TTAAC CTTTTAA GTTAA AGACT GAGAA TGCAGAC    TTCTC CTTAATG A